В каких документах отражаются накладные расходы и удержания по выполненным работам?

Здравствуйте, смотрю сводную ведомость по выполненным работам (по месяцам): стоимость выполненных работ (без НДС) - 916 336,87 руб.; накладных расходов (10%) - 91 633,68 руб.; стоимость работ с накладными расходами - 1 007 970,44 руб.; удержание Заказчиком за уборку и вывоз мусора - 16 000 руб.; итого по договору - 991 970,44 руб.
Пожалуйста, объясните новичку в этих делах, где и в каких документах нужно отразить накладные расходы и удержания Заказчиком (договор подряда, КС-2, КС-3, актах выполненных работ, общая ведомость работ)?